２００４年，中国科学院研究生院录取研究生新生１０６１１名，其中博士研究生４９０２名。１万多名新生中，有６０００余名新生在京外的教育基地以及培养单位开始研究生生活。

    在不断扩大培养规模的同时，中科院研究生院一直保持着较高的培养质量。１９９９年到２００４年，在全国百篇优秀博士论文的评选中，全国共评出优秀博士论文５９３篇，研究生院各培养单位共有９３篇论文入选，占全国总数的１５.７％；在中国管理科学研究院科学研究所推出的中国一流研究生院年度评价报告中，中科院研究生院连续三年以理学第一、工学第二的排名入选中国一流研究生院。

    中国科学院研究生院是由位于北京的研究生院本部，以及分处上海、武汉、广州、成都和兰州的５个教育基地以及１００多个研究生培养单位构成，是一个以北京本部为主体，联系和覆盖全国的网络式研究生教育体系。